Amazon RDS for MySQL 提供豐富的計費方式，如果選擇即用即付，可以使用按需實例定價，如果選擇可預測成本方式，可以選擇預留實例定價。
使用按需型實例，只需按小時支付數(shù)據(jù)庫費用，無需承諾長期使用或預付費。計費起止時間分別為數(shù)據(jù)庫實例啟動和停止或刪除時間。部分實例小時以 1 秒為增量計費，最低收取 10 分鐘的費用，然后提供可計費狀態(tài)更改（例如創(chuàng)建、啟動或修改數(shù)據(jù)庫實例）。
Amazon RDS for MySQL 根據(jù)數(shù)據(jù)庫集群配置以及用戶選擇啟用的可選功能，對數(shù)據(jù)庫實例、存儲費用、 I/O 收取費用、數(shù)據(jù)傳入或者傳出實例的費用、備份快照存儲費用。
基于使用的 RDS for MySQL 數(shù)據(jù)庫實例類型。在發(fā)生可計費狀態(tài)更改（例如創(chuàng)建、啟動或修改 RDS for MySQL 數(shù)據(jù)庫實例類型）后，將根據(jù)部分數(shù)據(jù)庫實例小時數(shù)計費。Amazon RDS for MySQL 支持按秒計費，在這種計費模式中，所消耗的部分數(shù)據(jù)庫實例小時數(shù)以一秒為增量計費，最低收取 10 分鐘的費用。
RDS for MySQL 數(shù)據(jù)庫實例預置的存儲容量。如果在一個月內擴展預置的存儲容量，則將按相應比例計費。
存儲 I/O 請求的總數(shù)量（例如： Amazon RDS 磁性存儲，通用型 SSD（gp3）超出基準性能的部分）
預調配 IOPS（io1）和預調配 IOPS（io2），可為生產數(shù)據(jù)庫工作負載提供高性能、高吞吐量和持續(xù)的亞毫秒級延遲。
傳入和傳出數(shù)據(jù)庫實例的 Internet 數(shù)據(jù)傳輸
包括客戶啟動的數(shù)據(jù)庫快照存儲和自動數(shù)據(jù)庫備份。當拍攝更多數(shù)據(jù)庫快照時，備份存儲空間會隨之增加。此外，延長備份保留期時，RDS for MySQL 數(shù)據(jù)庫使用的備份存儲空間也會增加。
專門用于存儲數(shù)據(jù)庫重做日志和二進制日志的附加存儲卷，它與包含數(shù)據(jù)庫表的卷分離，可提高事務寫入日志的效率和一致性。專用日志卷非常適合分配存儲空間大、每秒 I/O（IOPS）要求高的數(shù)據(jù)庫或延遲敏感型工作負載。
計費：當 RDS for MySQL 數(shù)據(jù)庫實例停止時，需要為預置存儲（包括預調配 IOPS）和備份存儲（包括指定保留時段內的手動快照和自動備份）付費，但無需為 RDS for MySQL 數(shù)據(jù)庫實例小時數(shù)付費。
刪除所有 RDS for MySQL 數(shù)據(jù)庫實例和快照，才能停止所有與 RDS for MySQL 相關的賬戶費用。如果僅停止 RDS for MySQL 數(shù)據(jù)庫實例，則無需為實例小時數(shù)計費，但仍會產生存儲費用。
假定在美國東部（弗吉尼亞州北部），連接到 RDS for MySQL 中的單可用區(qū)實例的 io1 專用日志卷，并且還有一個備用卷。 那么每月總費用將為：合計每月 850 USD。 其中專用日志卷每月將花費425 USD（ 0.125 USD x 1000 GiB + 0.10 USD x 3000 IOPS），備用卷每月將花費 425 USD（ 0.125 USD x 1000 GiB + 0.10 USD x 3000 IOPS）。